Pemilihan Ketua Ketua Komisariat IPNU-IPPNU menjadi Agenda Tahunan Madrasah.
Sebelum di pemilihan para kandidat calon melakukan debat dengan memaparkan Visi, Misi yang ingin di capai.
Pada Pemilihan Kali ini ada perbedaan dalam cara pemilihannya. Dulu pemilihan masih menggunakan paku dan kertas ( Manual ) yang biasa di terapkan di Pemilu di Indonesia tetapi sekarang pemilihan sudah Menggunakan E-Voting.

Awal mula Ide ini muncul karena keresahan Pembina, Pengurus dan anggota lainnya pada sistem kertas dan paku yang di nilai tidak praktis, memakan waktu dan membutuhkan biaya yang besar.
dengan adanya sistem ini di harapkan di setiap kegiatan dapat memanfaat perkembangan teknologi sehingga kegiatan lebih cepat, efisien dan lebih murah.